Kerajaan Malaysia diseru untuk melakukan siasatan jenayah terhadap pemegang saham MYAirline dan pegawai kerajaan yang telah meluluskan lesen perkhidmatan udara syarikat penerbangan tersebut. Ahli Parlimen Lim Lip Eng dari Kepong (Pakatan Harapan) menyuarakan keperluan untuk menghalang mereka yang bertanggungjawab terhadap syarikat penerbangan tersebut daripada meninggalkan negara dan menggantungkan aset mereka selama siasatan berlangsung. Beliau juga mendesak Kementerian Pengangkutan dan agensi berkuasa lain untuk mengambil tindakan, termasuk membatalkan lesen MYAirline serta menyiasat proses kelulusan dan sebarang unsur rasuah atau pelanggaran peraturan yang mungkin terlibat.
Lim Lip Eng menjelaskan bahawa siasatan terhadap MYAirline dan pemegang sahamnya harus dilakukan di bawah Akta Perkhidmatan Kewangan 2013, Akta Suruhanjaya Pencegahan Rasuah Malaysia, Akta Pencegahan Pengubahan Wang Haram, serta undang-undang berkaitan penipuan dan pecah amanah. Beliau menganggap tindakan ini penting untuk menjaga kepentingan penumpang dan pekerja, serta menghukum mereka yang terlibat dalam jenayah tersebut.
Cadangan Lim ini ditambah kepada usul Khairil Nizam Khirudin (Perikatan Nasional-Jerantut) yang menyeru Kementerian Pengangkutan untuk menjelaskan penyekatan tiba-tiba operasi MYAirline minggu lepas. Tindakan ini telah mencetuskan perdebatan di Dewan Rakyat, dengan Timbalan Menteri Pengangkutan Hasbi Habibollah menyatakan bahawa cadangan Lim diluar bidang kuasanya, tetapi agensi berkaitan mungkin akan mengkaji perkara tersebut.
Lim juga meminta jaminan daripada kerajaan bahawa dana awam tidak akan digunakan untuk menyelamatkan MYAirline. Hasbi menjawab bahawa era penyelamatan syarikat mungkin telah berakhir.
Ketika itu, Hasbi juga mengakui bahawa insiden yang melibatkan MYAirline merupakan pengajaran kepada Kementerian Pengangkutan dan agensinya dalam memeriksa permohonan lesen perkhidmatan udara. Ini adalah respons terhadap persoalan yang dibangkitkan oleh R Yuneswaran (Pakatan Harapan-Segamat) tentang keperluan untuk menyaring individu yang terlibat dalam pengendalian syarikat penerbangan untuk memastikan mereka tiada rekod kes jenayah atau aktiviti kewangan yang meragukan.
Hasbi menegaskan bahawa insiden ini akan menjadi rujukan dalam siasatan pihak berkuasa dan proses pemberian lesen pada masa akan datang. Beliau menjelaskan bahawa siasatan sedang dijalankan terhadap MYAirline dan syarikat tersebut diberi tempoh 14 hari untuk memberikan representasi kepada Pihak Berkuasa Penerbangan Awam (CAAM). Hasbi menegaskan bahawa tindakan pihak berkuasa hanya akan diambil setelah semua fakta telah disahkan.
Pada 12 Okt, MYAirline mengumumkan penggantungan operasinya atas alasan tekanan kewangan yang ketara. Menteri Pengangkutan pada masa itu, Anthony Loke mengkritik tindakan syarikat tersebut dan mengecamnya sebagai “tidak bertanggungjawab”. Pada hari Sabtu, MYAirline mengumumkan bahawa mereka akan menawarkan bayaran balik kepada penumpang yang terjejas akibat penggantungan operasi tersebut.